MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Agrobacterium vitis S4 chromosome 1

Total Repeats: 9886

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
4501	NC_011989	GCT	2	6	1709779	1709784	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4502	NC_011989	ATA	2	6	1709813	1709818	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4503	NC_011989	GGTC	2	8	1709863	1709870	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
4504	NC_011989	CGG	2	6	1709881	1709886	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4505	NC_011989	CGTTGT	2	12	1709892	1709903	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
4506	NC_011989	GATG	2	8	1709926	1709933	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4507	NC_011989	CTT	2	6	1709962	1709967	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4508	NC_011989	CCGT	2	8	1710012	1710019	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
4509	NC_011989	TGT	2	6	1711473	1711478	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4510	NC_011989	GCC	2	6	1711567	1711572	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4511	NC_011989	GCA	2	6	1711705	1711710	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4512	NC_011989	C	13	13	1713039	1713051	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4513	NC_011989	T	6	6	1713094	1713099	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4514	NC_011989	AG	4	8	1713109	1713116	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4515	NC_011989	CCGGC	2	10	1713682	1713691	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4516	NC_011989	GAAAT	2	10	1713793	1713802	60 %	20 %	20 %	0 %	Non-Coding
4517	NC_011989	GTC	2	6	1713829	1713834	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4518	NC_011989	CCG	2	6	1713989	1713994	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4519	NC_011989	TA	3	6	1714068	1714073	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4520	NC_011989	CGC	2	6	1714075	1714080	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4521	NC_011989	ATCC	2	8	1714159	1714166	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
4522	NC_011989	GGC	2	6	1714171	1714176	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4523	NC_011989	GCG	2	6	1714182	1714187	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4524	NC_011989	AAT	2	6	1714254	1714259	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4525	NC_011989	CCCTT	2	10	1714341	1714350	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
4526	NC_011989	AGG	2	6	1714352	1714357	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4527	NC_011989	GCC	2	6	1717822	1717827	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
4528	NC_011989	AGGC	2	8	1717885	1717892	25 %	0 %	50 %	25 %	Non-Coding
4529	NC_011989	CAT	2	6	1717902	1717907	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4530	NC_011989	CTG	2	6	1718317	1718322	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4531	NC_011989	ATT	2	6	1718481	1718486	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4532	NC_011989	ATT	2	6	1718533	1718538	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4533	NC_011989	GAA	2	6	1718550	1718555	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4534	NC_011989	GTC	2	6	1718604	1718609	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4535	NC_011989	TTG	2	6	1720639	1720644	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4536	NC_011989	T	6	6	1720646	1720651	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4537	NC_011989	CACTT	2	10	1720672	1720681	20 %	40 %	0 %	40 %	Non-Coding
4538	NC_011989	AT	3	6	1723756	1723761	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4539	NC_011989	AGAT	2	8	1723841	1723848	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4540	NC_011989	C	6	6	1723872	1723877	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
4541	NC_011989	AAACCG	2	12	1723907	1723918	50 %	0 %	16.67 %	33.33 %	Non-Coding
4542	NC_011989	GCG	2	6	1723945	1723950	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4543	NC_011989	GTT	2	6	1723951	1723956	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4544	NC_011989	AAT	2	6	1725652	1725657	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4545	NC_011989	CTGT	2	8	1725761	1725768	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4546	NC_011989	TCTG	2	8	1725788	1725795	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4547	NC_011989	GCA	2	6	1727059	1727064	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4548	NC_011989	GGAAA	2	10	1727086	1727095	60 %	0 %	40 %	0 %	Non-Coding
4549	NC_011989	TC	3	6	1728351	1728356	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4550	NC_011989	CAG	2	6	1730909	1730914	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4551	NC_011989	TC	3	6	1732235	1732240	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4552	NC_011989	CGCGC	2	10	1732246	1732255	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
4553	NC_011989	TGT	2	6	1732352	1732357	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4554	NC_011989	TTG	2	6	1732736	1732741	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4555	NC_011989	A	6	6	1732766	1732771	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4556	NC_011989	TTA	2	6	1732772	1732777	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4557	NC_011989	GCAT	2	8	1732806	1732813	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4558	NC_011989	GT	3	6	1732849	1732854	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4559	NC_011989	AGGG	2	8	1732881	1732888	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4560	NC_011989	GAGG	2	8	1733944	1733951	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4561	NC_011989	GAGGC	2	10	1735349	1735358	20 %	0 %	60 %	20 %	Non-Coding
4562	NC_011989	TGG	2	6	1736711	1736716	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4563	NC_011989	TTG	2	6	1736783	1736788	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4564	NC_011989	CTC	2	6	1736864	1736869	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4565	NC_011989	GT	3	6	1736890	1736895	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4566	NC_011989	TGC	2	6	1736903	1736908	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4567	NC_011989	GCT	2	6	1736914	1736919	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4568	NC_011989	TC	3	6	1736973	1736978	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
4569	NC_011989	TGT	2	6	1737003	1737008	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4570	NC_011989	GGC	2	6	1737042	1737047	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4571	NC_011989	TAG	2	6	1737074	1737079	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4572	NC_011989	TAC	2	6	1737101	1737106	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4573	NC_011989	AGGG	2	8	1737146	1737153	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
4574	NC_011989	AATG	2	8	1737839	1737846	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
4575	NC_011989	GAG	2	6	1738225	1738230	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4576	NC_011989	TA	3	6	1739728	1739733	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
4577	NC_011989	GGGC	2	8	1739735	1739742	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
4578	NC_011989	CGG	2	6	1740026	1740031	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4579	NC_011989	ATG	2	6	1741028	1741033	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4580	NC_011989	CTT	2	6	1742250	1742255	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4581	NC_011989	AAT	2	6	1743606	1743611	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4582	NC_011989	CTT	2	6	1743793	1743798	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4583	NC_011989	TCT	2	6	1745112	1745117	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4584	NC_011989	T	6	6	1746987	1746992	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4585	NC_011989	GCA	2	6	1750772	1750777	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4586	NC_011989	GAGAC	2	10	1750822	1750831	40 %	0 %	40 %	20 %	Non-Coding
4587	NC_011989	AAC	2	6	1754981	1754986	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4588	NC_011989	CAC	2	6	1755013	1755018	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4589	NC_011989	ATT	2	6	1755029	1755034	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4590	NC_011989	CGA	2	6	1755055	1755060	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4591	NC_011989	GAT	2	6	1756405	1756410	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4592	NC_011989	ATA	2	6	1757539	1757544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4593	NC_011989	TTA	2	6	1757546	1757551	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4594	NC_011989	AAT	2	6	1757554	1757559	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
4595	NC_011989	AGTG	2	8	1757647	1757654	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
4596	NC_011989	CAA	2	6	1758557	1758562	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4597	NC_011989	GTCTTT	2	12	1759178	1759189	0 %	66.67 %	16.67 %	16.67 %	Non-Coding
4598	NC_011989	GCA	2	6	1759227	1759232	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4599	NC_011989	GCG	2	6	1759246	1759251	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4600	NC_011989	ATTG	2	8	1759277	1759284	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
4601	NC_011989	GGTT	2	8	1759300	1759307	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4602	NC_011989	TTC	2	6	1759372	1759377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4603	NC_011989	GTT	2	6	1759386	1759391	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4604	NC_011989	A	6	6	1761254	1761259	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4605	NC_011989	GTTT	2	8	1761268	1761275	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
4606	NC_011989	TGC	2	6	1763546	1763551	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4607	NC_011989	GC	3	6	1763550	1763555	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4608	NC_011989	GCT	2	6	1763603	1763608	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4609	NC_011989	ATGC	2	8	1763686	1763693	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
4610	NC_011989	CGG	2	6	1763713	1763718	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4611	NC_011989	TCG	2	6	1764578	1764583	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4612	NC_011989	TGC	2	6	1764608	1764613	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4613	NC_011989	TGC	2	6	1764634	1764639	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
4614	NC_011989	GA	3	6	1764702	1764707	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
4615	NC_011989	GT	3	6	1765611	1765616	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
4616	NC_011989	TCC	2	6	1766849	1766854	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4617	NC_011989	TAT	2	6	1766907	1766912	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4618	NC_011989	GTCT	2	8	1768279	1768286	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
4619	NC_011989	GAAA	2	8	1768369	1768376	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
4620	NC_011989	CCT	2	6	1770887	1770892	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
4621	NC_011989	TTG	2	6	1770976	1770981	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4622	NC_011989	GCG	2	6	1771010	1771015	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4623	NC_011989	GC	3	6	1772706	1772711	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4624	NC_011989	GAT	2	6	1776082	1776087	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4625	NC_011989	GTG	2	6	1776088	1776093	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4626	NC_011989	TCT	2	6	1776097	1776102	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
4627	NC_011989	GTG	2	6	1776109	1776114	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4628	NC_011989	GC	3	6	1776116	1776121	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
4629	NC_011989	GTG	2	6	1776234	1776239	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
4630	NC_011989	A	7	7	1776254	1776260	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4631	NC_011989	T	6	6	1776265	1776270	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
4632	NC_011989	GAA	2	6	1778483	1778488	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
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